Stasiun Klimatologi Kelas II Nusa Tenggara Timur merupakan Unit Pelaksana Teknis di lingkungan Badan Meteorologi, Klimatologi, dan Geofisika (BMKG) yang terletak di Kota kupang, Nusa Tenggara Timur. Stasiun Klimatologi Kelas II Nusa Tenggara Timur masuk dalam wilayah III Balai Besar Meteorologi, Klimatologi, dan Geofisika (BBMKG). Dengan jumlah pegawai sebanyak 27 pegawai dengan rincian 20 orang Pegawai Negeri Sipil (PNS) dan 7 orang Pegawai Pemerintah Non Pegawai Negeri (PPNPN).
Dalam melaksanakan tugas, Stasiun Klimatologi Kelas II Nusa Tenggara Timur menyelenggarakan fungsi antara lain:
a. pengamatan klimatologi;
b. pengelolaan data klimatologi;
c. pelayanan informasi dan jasa klimatologi;
d. pemeliharaan alat klimatologi;
e. koordinasi/kerjasama, dan
f. pelaksanaan administrasi dan kerumahtanggaan stasiun.